مجموعه «میراث محفوظ»، تلاشی است به نوبه خود بجا و مهم، در معرفی و احیای متون و نسخ خطی در موضوعات متنوع اعم از علمی، هنری، ادبی، تاریخی و غیره برگرفته از آثار نفیس و قابل توجه موجود در موزه دکتر محمدصادق محفوظی می باشد که پس از این به صورت چاپ عکسی (فاکسیمیله) در قطع نیم رحلی، با تحقیقات و مقدمه های علمی پژوهشگران مختلف و صاحب نظر در این حوزه، منتشر خواهد شد. این مجموعه در سال 1402 شمسی، با حمایت موسس محترم موزه و مرکز (دکتر محمدصادق محفوظی) و با پیشنهاد و مدیریت اجرایی معاونت پژوهشی موزه (دکتر یوسف بیگ باباپور) آغاز شد و تبرکاً اولین شماره آن نسخه خطی نفیسی از نهج البلاغه شریف با رقم 722ق. می باشد که به زودی منتشر خواهد شد.
