مجموعه اسناد و فرامین :
این مجموعه آثار موزه شامل اسناد و فرامین تاریخی ، دست نوشته ها ، مکاتبه ها ، عقدنامه ها و صلح نامه ها همراه با سجئیات اعتباری و ممهور به مهرهای رجال حکومتی ، دینی ، مذهبی ، مراجع تقلید ، تجار ، شخصیتهای برجسته کشوری و لشگری و امنای اصناف و دربار می باشد . سجئیات اعتباری در واقع به طریقی تایید و ثبت و اجرای اسناد و احکام و فرامین می باشد .
این مجموعه ی اسناد علاوه بر ارزشهای تاریخی که بیانگر روابط حکومتی و نظامی ، روابط اقتصادی و زمین داری ، روابط مذهبی و دینی ، روابط اقوام و قومیت های ایرانی و غیر ، روابط خانوادگی و مرامی هستند .
این مجموعه اسناد موزه خود جلوه گاه هنرهای ناب ایرانی نظیر خوشنویسی ، تذهیب ، تشعیر ، طراحی و نقاشی و ... می باشند .
در این مجموعه ی آثار شیوه های خوشنویسی خطوط نظیر خط تعلیق ، نستعلیق ، شکسته ، نسخ ، رقاع ، ثلث ، ریحان و سیاق و ... دیده می شود و نیز در کنار خطوط ، شاهد آرایه های هنری دیگری چون طغرای نویسی ، نقش مهر ، تذهیب ، توشیح ، سرلوح های تذهیب و جدول کشی و ... هستیم ، که خود محل پژوهش های بسیار ارزشمندی در زیبا شناختی هنرهای ایرانی کمتر شناخته شده است .
در این مجموعه اسناد موزه ، فرمانهایی از شاهان صفوی تا قاجاری و همچنین نقش طغرای و نقش مهر و نیز توشیح و دست نوشته های سلاطین و حاکمان و والیان گذشته موجود می باشد که غالباٌ با تذهیب و طلا اندازی و آرایه های ویژه هنری نیز همراه است .